期刊简介
本刊是由中国免疫学会和第四军医大学共同主办，为国内外公开发行的国家级科技期刊，属于全国中文核心期刊、中国科技论文统计源期刊、中国科学引文数据库源期刊及美国《CA》刊源。
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首页>细胞与分子免疫学杂志
- 杂志名称：细胞与分子免疫学杂志
- 主管单位：中国免疫学会；第四军医大学
- 主办单位：陕西省免疫学会,中国免疫学会
- 国际刊号：1007-8738
- 国内刊号：61-1304/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：全军优秀编辑奖（96）期刊收录：CA 化学文摘(美), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 知网收录(中), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 文摘与引文数据库, 上海图书馆馆藏, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 国家图书馆馆藏
人乳头瘤病毒16型L1蛋白B细胞表位预测
王爱萍；蒋敏；栗宁；张改平；祁艳华；刘燕凯；席宇；周景明
关键词：人乳头瘤病毒, L1蛋白, 宫颈癌, B细胞表位, 生物信息学
摘要：目的 预测人乳头瘤病毒16型L1(HPV-16 L1)蛋白的B细胞表位.方法 先从NCBI的蛋白质数据库中获得HPV-16 L1蛋白的氨基酸序列,再采用DNAStar中的Protean模块分析HPV-16型L1蛋白的二级结构、柔韧性、亲水性、表面可及性以及抗原性,然后结合吴玉章等建立的氨基酸抗原性指数方法计算其平均抗原指数(AI),综合分析上述多个参数,预测其可能的B细胞表位区域,并用在线BLAST进行同源性匹配分析.结果 综合分析多个参数,预测得出HPV-16 L1蛋白的B细胞表位可能位于第51 ～58、87 ～ 97、214 ～ 220、290 ～ 296、335 ～341、351 ～ 366、408 ～418、430 ～442和475 ～496肽段,进一步的同源性匹配分析显示肽段51 ～58、335 ～341、351 ～366、408 ～418、430 ～442以及475 ～496为其B细胞表位优势区域,其中肽段51(PIKKPNNN)58、351(SETTYKNTNFKEYLRH) 366、408(PPPGGTLEDTY)418和430(KHTPPAPKEDPLK) 442的氨基酸序列为HPV-16型L1蛋白所特有,而肽段475(KAKPKFTLGKRKATPTTSSTST)496与HPV-16 E1蛋白具有同源性、335(DTTRSTN)341的氨基酸序列与很多其他型别的HPV的L1蛋白具有同源性.结论 综合多种方案预测得到HPV-16 L1的多个B细胞表位优势区域.
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